A Malwarebytes Anti-Malware valós idejű lehetőséget biztosít különféle kártevők eltávolítására, amely során a rendszerleíró-adatbázis mellett a háttértárolókat, illetve a futó folyamatokat is ellenőrzi és megakadályozza indulásukat. Az ellenőrzések történhetnek gyorsított módszerrel, illetve mélyebb részletesebb vizsgálattal. Adatbázisa online frissíthető.